El templo tiene varias estructuras con valor histórico. El Soshi-do (salón del fundador), designado como tesoro cultural nacional, fue reconstruido en la era de Enpo (1673-81). Otros tesoros culturales nacionales son el salón principal Hokke-do, construido en la era de Muromachi, y la puerta Shisoku-mon. Hokke-do es la estructura más antigua y se cree que es la estructura principal del Honmyoji. Goju-no-to (la pagoda de cinco pisos), construida en 1622, también es un tesoro nacional. Hay una adición importante, el Shogyo-den, construido en 1931. Otras adiciones son las siguientes: Kishimojin-do, Aragyo-do y Joshuden (la casa de huéspedes).

El templo mantiene también varios tesoros nacionales sagrados: el “Rissho Ankoku Ron,” “Kanjin Honzon Sho,” originales de Nichiren Shonin y 56 volúmenes de sus escritos originales que se muestran al público una vez por año el 3 de noviembre. Una cantidad innumerable de documentos históricos, la estatua de Nichiren Shonin, varias otras estatuas y arte sagrado antiguo que data hasta la Edad Media.